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  农业环境科学学报  2018, Vol. 37 Issue (3): 559-566

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孔德望, 张克强, 房芳, 高文萱, 梁军锋, 梁雨, 杜连柱
KONG De-wang, ZHANG Ke-qiang, FANG Fang, GAO Wen-xuan, LIANG Jun-feng, LIANG Yu, DU Lian-zhu
猪粪厌氧发酵消化液回流体系微生物群落结构特征与产气关系研究
Study of microbial community and biogas production in anaerobic digestion of pig manure with digested slurry recirculation
农业环境科学学报, 2018, 37(3): 559-566
Journal of Agro-Environment Science, 2018, 37(3): 559-566
http://dx.doi.org/10.11654/jaes.2017-1241

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收稿日期: 2017-09-12
录用日期: 2017-11-27
猪粪厌氧发酵消化液回流体系微生物群落结构特征与产气关系研究
孔德望1,2 , 张克强2 , 房芳3 , 高文萱2 , 梁军锋2 , 梁雨2 , 杜连柱2     
1. 沈阳农业大学土地与环境学院, 沈阳 110866;
2. 农业部环境保护科研监测所, 天津 300191;
3. 天津环科源环保科技有限公司, 天津 300191
摘要: 为明确厌氧发酵消化液回流体系中微生物群落结构的特征,采用Miseq高通量测序技术,研究回流过程中微生物的多样性和群落结构变化,并分析其与产气性能的关系。结果表明:消化液回流体系中,细菌的丰富度、多样性均高于产甲烷古菌,并随回流时间的延长明显增加,而产甲烷古菌无明显变化;细菌群落主要分为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)等8个不同的门类,厚壁菌门、梭菌纲(Clostridia)、梭菌属(Clostridium)是不同水平上的优势细菌,相对丰度分别从初期的62.79%、58.62%、35.44%上升到81.46%、68.19%、39.10%;产甲烷古菌中,广古菌门(Euryarchaeota)占绝对优势,在接种物中,第68 d和第219 d相对丰度分别为94.76%、99.89%、99.59%,属分类上主要有7种,其中甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)的相对丰度由23.99%升高到72.28%,而甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)和甲烷球菌属(Methanosphaera)分别由16.34%、21.71%降低至3.70%、12.93%;日平均产气率由初期的409 mL·g-1升高至477 mL·g-1,在219 d的试验中,氨氮和有机酸浓度均呈升高趋势,但并未对厌氧发酵产生抑制作用。研究表明:厌氧发酵回流体系中微生物以梭菌属和甲烷八叠球菌属为优势菌属,产气率随其相对丰度的增大而升高,而与甲烷短杆菌属和甲烷球菌属呈负相关。
关键词: 厌氧发酵     回流     猪粪     微生物群落     生物多样性    
Study of microbial community and biogas production in anaerobic digestion of pig manure with digested slurry recirculation
KONG De-wang1,2, ZHANG Ke-qiang2, FANG Fang3, GAO Wen-xuan2, LIANG Jun-feng2, LIANG Yu2, DU Lian-zhu2     
1. College of Land and Environment, Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, China;
2. Agro-Environmental Protection Institute, Ministry of Agriculture, Tianjin 300191, China;
3. Tianjin Huankeyuan Environmental Science and Technology Limited, Tianjin 300191, China
Project supported: The National Key Research and Development Program of China(2016YFD0501407); The Natural Science Foundation of Tianjin, China(16JCYBJC29600); The Transformation Program of Agricultural Scientific and Technological Achievement, Tianjin, China(201601290)
Abstract: In order to investigate the characteristics of microbial community and its relationship with biogas production in an anaerobic digestion reactor with digested slurry recirculation, a continuous stirred-tank reactor(CSTR) was operated and the microbial community was analyzed by Miseq high-throughput sequencing. Results indicated that the richness and diversity of bacteria were higher than that of archaea, and they increased in bacteria, but no obvious difference could be observed in archaea, even by prolonging the experiment time. The bacterial structures consisted of eight categories, such as Firmicutes, Bacteroidetes, and Proteobacteria at phylum level. Firmicute was the most prevalent in the reactor; its relative abundance increased from 62.79% to 81.46%. The main class and genus were Clostridia and Clostridium, whose relative abundance changed from 58.62% and 35.44% to 68.19% and 39.10%, respectively. For archaeal communities, Euryarchaeota showed an absolute predominance, accounting for 94.76%, 99.89%, and 99.59% at inoculation, 68 d, and 219 d, respectively. This phylum included seven genera, of which the relative abundance of Methanosarcina increased from 23.99% to 72.28%, but that of Methanobrevibacter and Methanosphaera decreased from 16.34% and 21.71% to 3.70% and 12.93%, respectively. Specific methane yield increased from 409 mL·g-1 to 477 mL·g-1. The concentration of ammonia and VFA increased gradually, and the biogas yield was maintained at a relatively high level without any inhibition. The results indicated that Clostridium and Methanosarcina were the dominant genera in the reactor, and the relative abundance increased with an increase in recirculation time. The specific methane yield showed positive correlations with the relative abundance of Clostridium and Methanosarcina, whereas it showed negative correlations with Methanobrevibacter and Methanosphaera.
Key words: anaerobic digestion     recirculation     pig manure     microbial community     microbial diversity    

随着我国养殖业集约化、规模化的快速发展,畜禽粪便产量逐年增加,正确处理和利用养殖废弃物已成为养殖业健康良性发展的关键因素。厌氧消化因其工艺相对简单、活性污泥量少而逐渐成为有机废弃物处理的主要技术之一,在畜禽养殖废弃物处理和资源化利用中得到越来越广泛的应用。

厌氧消化性能受温度、pH、有机负荷、回流等众多因素的影响,其中消化液的回流能够减少微生物流失和沼液排放量、提高发酵体系的缓冲能力、缓解沼液后续深度处理的压力[1]。Estevez等[2]研究了消化液回流对牛粪和汽爆过的沙柳混合半连续厌氧发酵的作用,结果表明,1:1的回流比能够提高沼气中的甲烷含量,同时甲烷产率提高16.0%。吴树彪等[3]在牛粪的厌氧发酵研究中发现,固液分离后的消化液回流使基质的产甲烷率提高16.3%,但随着回流的进行,日产甲烷量呈下降趋势。Nordberg等[4]的研究结果表明,消化液回流能够增加青贮苜蓿厌氧发酵体系的pH、碱度和稳定性。高新星等[5]对比了固体产酸发酵反应器中消化液浸泡和喷淋两种回流方式对猪粪和秸秆混合原料两相厌氧消化性能的影响,发现在消化液浸泡回流方式下累积产气量是喷淋回流的2倍,而且稳定性更好,单位质量总固体产气量可达217.88 mL·g-1

以往的研究主要针对固液分离后的消化液回流,重点集中在对产气性能的影响,对消化液直接回流及直接回流过程中微生物的群落变化及其与产气之间的关系研究不足。邓遵等[6]研究了ABR反应器出水回流对微生物种群的影响,结果表明,与不回流相比,回流反应器中真细菌、古细菌、产氢产乙酸菌和耗氢产乙酸菌的相对丰度分别高出8.5%、4.5%、3.5%和3.0%。Zamanzadeh等[7]研究了消化液回流对食品废水厌氧消化中微生物的影响,结果表明,中温条件下,回流和不回流体系中优势古菌均为甲烷鬃毛菌属,细菌群落结构存在明显差别,门水平上优势菌分别为厚壁菌门和绿屈挠菌门,而高温条件下的微生物群落则非常相似。

本试验采用实验室猪粪中温厌氧消化连续试验,研究消化液直接回流过程中微生物群落结构组成变化特征,并分析其与产气性能的关系,为优化规模化养殖场大中型沼气工程的运行参数、提高产气效率提供有益参考。

1 材料与方法 1.1 试验材料

猪粪取自天津市西青区某养殖有限公司,取当日产鲜猪粪冷藏于(4±1)℃的冰箱。接种物取自实验室正常运行的有机负荷(OLR)为4.0 g·L-1·d-1的猪粪中温混合厌氧反应器(Continuous Stirred Tank Reactor,CSTR)。底物与接种物的理化指标见表 1

表 1 底物和接种物的基本性质 Table 1 Characteristics of substrates and inoculum sludge
1.2 试验装置

试验装置为有机玻璃材质的CSTR反应器,有效容积7 L。反应器顶部安装搅拌装置,设有进料口、排气口,侧部设上下两个取样口,底部设有出料口,反应器采用双层结构,恒温水浴加热(图 1)。

1.搅拌器;2.进料口;3.测温口;4.排气口;5、6.取样口;7.进水口8.出水口;9.出料口 1. Stirrer device; 2. Feeding port; 3. Temperature monitoring; 4. Gas outlet 5, 6. Sampling ports; 7. Water inlet; 8. Water outlet; 9. Discharge port 图 1 厌氧发酵试验装置图 Figure 1 Experimental equipment of anaerobic digestion
1.3 试验设计

厌氧发酵的OLR为4.0 g·L-1·d-1(以VS计),水力停留时间(HRT)为30 d。试验启动前,在反应器内装填4 L接种物,加水至7 L。启动阶段,每天排出约233.3 mL的消化液,定量称取猪粪加蒸馏水至约233.3 mL,混匀后填充至反应器。运行稳定后,出料的50%替代蒸馏水进入反应器,回流试验共进行219 d。反应器通过双层水浴加热,保持发酵温度为(35±0.5) ℃。试验采取间歇搅拌方式,每搅拌2 h停10 min,转数为50 r·min-1

每天测量产气量,每2 d测量气体中CH4和CO2的百分含量,每3 d取消化液分析pH值、挥发性脂肪酸(VFAs,乙酸、丙酸、丁酸和戊酸)、氨氮等指标。取接种物(S0)、试验第68 d(S1,1~68 d,短期回流)和第219 d(S2,69~219 d,长期回流)消化液样品(重复取样3次)用于微生物群落分析。

1.4 理化指标分析

产生的沼气收集于气袋中,通过湿式气体流量计测量体积,消化液pH、氨氮浓度采用标准方法测定[8],CH4和CO2的百分含量及VFAs浓度采用前期试验[9]的处理及分析方法。

1.5 Miseq高通量测序分析 1.5.1 样品DNA提取

样品DNA采用Fast DNAs Spin Kit(Mpbio,美国)试剂盒提取,S0、S1和S2的重复样品(3个)分别提取DNA,利用1%琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA的完整性,通过超微量分光光度计(Nano Drop 2000,Thermo Scientific,Wilmington,美国)测定浓度,然后将提取的DNA混匀。

1.5.2 PCR扩增

细菌扩增引物为341F(5′-CCTACACGACGCTCT TCCGATCTG(barcode)CCTACGGGNGGCWGCAG-3′)和805R(5′-GACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATT CCAGACTACHVGGGTATCTAATCC-3′),产甲烷古菌扩增引物为349F[5′-CCCTACACGACGCTCTTCCG ATCTN(barcode)GYGCASCAGKCGMGAAW-3′]和806R(5′-GACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTC CAGGACTACVSGGGTATCTAAT-3′)[10]。采用PCR仪(C100 Thermal Cycler)对样品16S rDNA基因进行PCR扩增,扩增反应体系及条件参照文献[11-12],对PCR产物进行琼脂糖电泳,采用生工琼脂糖回收试剂盒(Cat:SK8131)对PCR产物进行回收,回收产物用Qubit 2.0定量。

1.5.3 Miseq测序

样品送生工生物工程(上海)股份有限公司,测序平台为Miseq 2x300,测序后的DNA序列进行拼接,通过barcode标签序列区分样品序列,采用Prinseq(0.20.4)对样本序列做质量控制,在QIIME中调用Uclust(1.1.579)软件,设置97%相似性,对有效DNA序列数据进行操作分类单元(OTU)分类,采用RDP软件比对Silva数据库进行物种分类,在门、纲、目、科和属分类水平上统计样本的物种丰度。采用Mothur软件计算种群丰富度指数(Chao指数、ACE指数)和群落多样性指数(Shannon指数和Simpson指数)。

2 结果与讨论 2.1 沼气发酵性能参数

表 2为厌氧发酵在短期长期回流下沼气产率、氨氮浓度、乙酸浓度、pH值等参数的平均值。由表可见,消化液回流的平均VS产气率由409 mL·g-1升高到477 mL·g-1,氨氮、乙酸的平均浓度和pH值也明显升高,但沼气中的CH4百分含量有所降低。

表 2 沼气产率及反应器关键指标 Table 2 Variations of biogas yield and key factors
2.2 微生物群落多样性分析

在OTUs(操作分类单位)为97%的相似性水平下,对厌氧消化过程中细菌和古菌微生物群落多样性进行分析比较(图 2图 3表 3)。由图 2图 3可知,尽管细菌和古菌的稀释曲线未达到平坦状态,但Shannon指数曲线随着序列数的增加迅速趋于平坦,表明测序数量能够反映样品中绝大多数微生物信息[11]。从图 2稀释曲线和表 3中Chao和ACE指数可知,随着消化时间的延长,厌氧发酵体系中细菌和古菌群落的丰富度均有所提高,细菌的丰富度增加幅度明显高于古菌。

表 3 发酵过程中微生物丰富度和多样性变化 Table 3 Richness and diversity of microbial communities during digestion
图 2 细菌和古菌的稀释曲线 Figure 2 Rarefaction curves of bacteria and archaeal communities
图 3 细菌和古菌的Shannon指数曲线 Figure 3 Shannon index curves of bacteria and archaeal communities

表征微生物群落多样性的Shannon指数变化趋势与Chao、ACE指数相似,随着发酵的进行呈升高趋势,表明细菌群落多样性增加,群落的复杂程度升高,而古菌的Shannon指数基本没有变化,表明长期消化液回流对古菌群落的多样性和复杂程度影响不大。厌氧发酵体系中,微生物群落多样性越高产沼气性能越好,虽然S2中产甲烷古菌的多样性没有明显增加,但细菌多样性提高了16.1%,从而导致了沼气产率的提升。

Simpson指数体现了优势物种生物量占群落生物总量的比重,该指数越大表明优势菌群生物量占总生物量比重越小,反之则优势菌群生物量占总生物量比重越大[12]。与Shannon指数不同,随着厌氧发酵的进行细菌的Simpson指数降低,而产甲烷古菌的升高,表明细菌优势菌群的生物量占总生物量的比例增大,古菌优势菌群的占比减小。

综合各指数可以看出,与产甲烷古菌相比,厌氧发酵体系中的细菌具有更高的微生物种群丰富度和多样性,与已有研究报道相一致,这主要是由细菌和产甲烷古菌遗传发育的多样性差异造成的[13]

2.3 细菌群落结构变化

不同发酵时期样品中细菌群落在门、纲和属的分类水平见图 4。由图 4a可知,细菌主要属于8个门,其中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为主要的优势菌群,在S0、S1和S2中的相对丰度分别为62.79%、71.66%、81.46%和19.39%、20.32%、6.74%;其次是变形菌门(Proteobacteria)和无壁菌门(Tenericutes),相对丰度分别为2.59%、1.84%、3.23%和0.04%、0.11%和1.96%;未分类菌门则为12.75%、3.41%和3.36%。

图 4 细菌群落结构变化 Figure 4 Variation of bacteria communities structure

厚壁菌门是厌氧发酵水解酸化阶段最优势的细菌类群,能够产生降解复杂有机物的纤维素酶、蛋白酶和各种胞外水解酶,在高浓度氨氮的厌氧消化体系中,很多已知的同型乙酸氧化(SAO)菌属于该门类微生物[14-15]。Sundberg等[16]的研究结果显示,在餐厨和屠宰场等废弃物的中温混合厌氧发酵中,厚壁菌门的相对丰度达到83%。Li等[14]对我国12个以猪场粪污为原料的厌氧沼气工程微生物分析结果显示,厚壁菌门的平均丰度为63.73%,其在5个沼气工程中占绝对优势,平均丰度达到78.44%,另外,牛场和猪场废弃物厌氧消化中,游离氨与厚壁菌门成显著正相关。试验中不同阶段厚壁菌门均占绝对优势,而且随着回流时间的延长其相对丰度逐渐升高,达到81.46%,这可能与体系中氨氮浓度逐渐升高有关。拟杆菌门和变形菌门是污泥水解和产酸的主要菌。试验中,发酵液长期回流对拟杆菌门细菌影响明显,相对丰度从初期的20%左右降至219 d时的6.74%,而变形菌门和无壁菌门变化较小。

属于厚壁菌门(Firmicutes)的梭菌纲(Clostridia)包含数量众多的微生物,具有降解蛋白、脂肪和碳水化合物等多种物质的功能,同时能够将乙酸和乳酸转化为H2和CO2[17-18]。试验中,梭菌纲在不同时期均占明显优势,占比分别为58.62%、65.60%和68.19%(图 4b),相对丰度逐渐升高,表明该种群在水解酸化过程中较其他纲微生物具有更强的竞争力,同时反映出消化液回流的厌氧消化系统中梭菌纲与氢营养型甲烷菌的互养关系占主导,并呈加强趋势[18]。另一种优势微生物为拟杆菌纲(Bacteroidia),占比分别为2.45%、4.31%和4.92%。其他主要微生物相对丰度几乎均呈升高趋势,但不大于3.88%。

图 4c为属分类水平上细菌群落结构,虽然大量的细菌序列未能分类,但属水平上的群落结构仍能提供反应器中微生物群落功能的重要信息[18-19]。由图可知,相对丰度高于1.00%的细菌基本属于厚壁菌门、梭菌纲,以梭菌属(Clostridium)为优势菌属,相对丰度由S0的35.44%经S1的35.77%升高至S2的39.10%,与日平均产气率的变化一致,表明日平均产气率与梭菌属的丰度呈正相关。第二优势菌属为具有纤维素降解能力的Saccharofermentans,相对丰度从11.64%经13.9%下降到5.25%。未分类的细菌在各个阶段的相对含量分别为28.57%、27.43%和20.66%,表明还存在较多的细菌尚未被分类,需要更深入的研究和挖掘。

2.4 古菌群落结构变化

图 5为消化液回流不同阶段产甲烷古菌在门、纲、目、科和属水平上的群落结构。由图 5a可知,在S0、S1和S2中,产甲烷菌在门水平上非常单一,广古菌门(Euryarchaeota)占绝对优势,其相对丰度分别为94.76%、99.89%和99.59%,泉古菌门(Crenarchaeota)则只占4.40%、0.08%和0.11%。纲水平上(图 5b)甲烷微菌纲(Methanomicrobia)和甲烷杆菌纲(Methanobacteria)是优势微生物,但随消化液回流时间的延长表现出不同的变化规律,甲烷微菌纲由S0的53.35%升高至S1和S2的56.97%和78.09%,而甲烷杆菌纲则由S0的38.34%最终下降至S2的16.78%。

图 5 产甲烷古菌群落结构变化 Figure 5 Variation of archaeal communities structure

目水平上,各产甲烷菌的相对丰度大小表现为甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)>甲烷杆菌目(Meth-anobacteriales)>甲烷微菌目(Methanomicrobiales),消化过程中,前者处于升高的趋势,中者下降,后者下降,但变化不大,科水平上的古菌相对丰度变化与目水平一致。有研究表明,不同产甲烷菌对体系中有害物质或环境因子具有不同的抵抗能力,高沼气产率下,甲烷八叠球菌目(科)占比高于其他古菌[20-22]。试验中,随着回流时间的延长,虽然对产甲烷微生物具有毒害作用的氨氮的浓度逐渐升高达到5371 mg·L-1,但沼气的VS产率达到477 mg·g-1(表 2),这与高氨氮浓度下甲烷八叠球菌科的相对丰度较高有关。

虽然整个发酵过程中产甲烷古菌的多样性差异较小(表 3),但在属水平上分类的差异却非常明显(图 5e),可分为7个属,其中甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)和甲烷球菌属(Methanosphaera)为优势菌属。甲烷八叠球菌属相对丰度由S0的23.99%依次升高到S1的56.55%和S2的72.28%,而甲烷短杆菌和甲烷球菌属的相对丰度总体呈降低趋势,分别由16.34%、21.71%降低至3.70%、12.93%,表明回流体系的产气率与甲烷八叠球菌属的相对丰度呈正相关,与甲烷短杆菌属和甲烷球菌属呈负相关。其他菌属还包括甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)、甲烷囊菌属(Methanoculleus)、热裸单胞菌属(Thermogymnomonas)、甲烷螺菌属(Methanospirillum)。

作为畜禽粪污厌氧发酵中常见的优势产甲烷菌属,甲烷八叠球菌属是已知的唯一能够利用所有产甲烷途径的菌属,很多文献都将其归结为乙酸营养型产甲烷菌[23-24],然而这需要进一步研究。试验中,随着发酵时间的延长,甲烷八叠球菌属的相对丰度升高,而包括甲烷短杆菌属、甲烷球菌属和甲烷囊菌属(Methanoculleus)等在内的氢营养型产甲烷菌的总占比在S0和S1中基本相同(43.10%和43.14%),在S2中则下降至22.54%,表明在回流初期多种微生物对甲烷产生的贡献相当,随着回流时间的延长,逐渐以甲烷八叠球菌属的代谢为主,其主要原因可能是:(1)接种物取自长期运行的猪粪厌氧消化反应器,经过高浓度氨氮的驯化,具有较高的氨氮耐受浓度;(2)甲烷八叠球菌属对氨氮具有高达7000 mg·L-1的耐受浓度[25],虽然体系中氨氮浓度达到5371 mg·L-1,但未对甲烷八叠球菌属产生抑制。

值得注意的是,同属乙酸营养型产甲烷菌的甲烷鬃毛菌属和甲烷八叠球菌属在本研究中表现迥然不同,甲烷八叠球菌属占绝对优势,而甲烷鬃毛菌属S0时为24.14%,S1和S2时则低于0.05%,主要原因是甲烷鬃毛菌属对乙酸和氨氮均比甲烷八叠球菌属敏感[22]。甲烷鬃毛菌属只能代谢乙酸,能在低至0.3~1.2 mg·L-1的浓度环境中生长,在93.7~140.6 mg·L-1的浓度范围内为优势菌属,而甲烷八叠球菌属所需最小乙酸浓度约为60.1 mg·L-1,在234.3~468.6 mg·L-1以上时为优势菌属[23, 25]。试验中,S1和S2的乙酸浓度分别为52.5 mg·L-1和3 397.7 mg·L-1,均不在甲烷鬃毛菌属的最适乙酸浓度内,但是甲烷八叠球菌属在S2时期处于适宜的乙酸浓度内,因此甲烷八叠球菌属表现出更强的竞争力[26]。另外,有机负荷也影响乙酸营养型产甲烷菌。有文献[27]报道,在低有机负荷下甲烷鬃毛菌属占优势,而高有机负荷下甲烷八叠球菌属占优势,本试验VS负荷为4.0 g·L-1·d-1,处在较高水平。

3 结论

(1) 在消化液回流过程中,细菌较古菌具有更高的多样性和丰富度,并且随着回流时间的延长有所提高,而产甲烷古菌变化不明显。

(2) 消化液回流的不同时期,细菌以厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)为主,梭菌属(Clostridium)占绝对优势,古菌以甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)为主,且随回流时间的延长,优势更加明显,这与甲烷八叠球菌属具有高的氨氮和乙酸耐受浓度有关。

(3) 回流过程中,发酵体系的日平均产气率与梭菌属和甲烷八叠球菌属的相对丰度呈正相关,而与甲烷短杆菌属和甲烷球菌属呈负相关。

(4) 在219 d的发酵周期内,回流导致氨氮和挥发性有机酸浓度升高,产气效率维持在较高水平,虽未表现出抑制作用,但长期运行应关注氨氮浓度变化对微生物和产气效率的影响。

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