DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤<sup>15</sup>N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法

苟永刚; 余玲玲; 许霞; 王建武

文章摘要

苟永刚,余玲玲,许霞,王建武.DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤¹⁵N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法[J].农业环境科学学报,2019,38(1):140-147.

DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤¹⁵N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法

Identification of ¹⁵N-DNA enrichment sites in DNA-SIP to reveal functional genes by qPCR from sugarcanesoybean intercropping soil

投稿时间：2018-03-15

DOI：10.11654/jaes.2018-0343

中文关键词: 甘蔗//大豆间作稳定性同位素核酸探针荧光定量PCR 功能基因

英文关键词: sugarcane-soybean intercropping stable isotope probing real-time PCR functional genes

基金项目:国家自然科学基金项目（31600348）

作者	单位	E-mail
苟永刚	华南农业大学热带亚热带生态研究所, 广州 510642 农业农村部华南热带农业环境重点实验室, 广州 510642 华南农业大学资源环境学院生态学系, 广州 510642
余玲玲	华南农业大学热带亚热带生态研究所, 广州 510642 农业农村部华南热带农业环境重点实验室, 广州 510642 华南农业大学资源环境学院生态学系, 广州 510642
许霞	华南农业大学热带亚热带生态研究所, 广州 510642 农业农村部华南热带农业环境重点实验室, 广州 510642 华南农业大学资源环境学院生态学系, 广州 510642
王建武	华南农业大学热带亚热带生态研究所, 广州 510642 农业农村部华南热带农业环境重点实验室, 广州 510642 华南农业大学资源环境学院生态学系, 广州 510642	wangjw@scau.edu.cn

摘要点击次数: 2384

全文下载次数: 2908

中文摘要:

为筛选有效鉴定甘蔗//大豆间作系统的稳定性同位素核酸探针技术（DNA-SIP）中超高速离心后¹⁵N-DNA富集位置的指示功能基因，利用实时荧光定量PCR技术（qPCR），检测6个氮素循环功能基因在不同浮力密度离心液DNA中的相对丰度分布，通过对氮素循环功能基因相对丰度作图分析，nifH和amoA基因在甘蔗//大豆间作和大豆单作种植模式中¹⁵N标记组与对照组基因丰度峰发生偏移，chiA基因丰度峰仅在大豆单作种植模式下存在偏移，而nirS、nirK、nosZ等3个基因的丰度峰值在两种种植模式下均不发生偏移。结果表明nifH和amoA基因可作为指示基因，能够有效鉴定甘蔗//大豆间作系统中DNA-SIP技术¹⁵N-DNA位置。

英文摘要:

Using DNA stable isotope probes(DNA-SIPs) is a reliable, new technique for studying the nitrogen cycle. To identify indicator function genes of ¹⁵N-DNA enrichment in ultra-high-speed centrifugation in a sugarcane-soybean intercropping system for DNA-SIPs, the relative abundance distributions of six nitrogen cycling functional genes in the DNA of different buoyant density centrifugation fluids were detected via real-time PCR(qPCR). Through the analysis of the relative abundance of nitrogen cycling functional genes, the gene abundance peaks of the nifH and amoA genes in sugarcane-soybean intercropping and soybean monoculture were shifted in the ¹⁵N marker group and the control group, the gene abundance peaks of chiA were only shifted in soybean monocropping mode, and the abundance peaks of nirS, nirK, and nosZ did not shift with either planting pattern. The results showed that the nifH and amoA genes could be used as indicator genes to effectively identify DNA-SIP technology ¹⁵N-DNA positions in sugarcane-soybean intercropping systems.

HTML 查看全文查看/发表评论下载PDF阅读器