通过对不同水稻品种甲烷排放量与水稻通气组织相关性分析，确定聚类指标，运用离差平方和聚类分析方法对水稻品种进行聚类，初步探讨了水稻植物学特性与甲烷排放的相关性。结果表明，早、晚稻不同水稻品种甲烷排放量与植株显著相关的指标是不同的。早稻品种植株第2节间茎秆维管束总面积、第2节间茎秆壁厚、第2节间叶鞘横切面积/节间横切面积、第2节间叶鞘气腔面积/叶鞘与茎秆横切面积之和4个指标与甲烷排放量呈显著相关关系。晚稻品种植株株高与茎秆长度、第3节间茎壁横切面积/节间横切面积、第3节间茎壁髓腔面积/节间横切面积、第3节间叶鞘横切面积/节间横切面积、第3节间叶鞘维管束面积/节间横切面积、第3节间叶鞘气腔面积/茎壁横切面积、第3节间茎秆维管束面积/茎秆横切面积8个数量指标与甲烷排放量都呈显著相关性。分别以上述相关因子为聚类指标，对早、晚稻品种进行聚类分析，都可分为甲烷排放量高、中、低3类，与实测结果吻合度分别为87.5%和90%。因此，所选指标作为水稻品种甲烷排放量等级聚类指标是可行的，为水稻品种甲烷排放量定性分析提供了实践及理论依据。本研究将为水稻品种甲烷排放量等级区分提供依据，为高产杂交稻、超级稻的育成与推广提供环境学支撑。