为探讨大棚种植年限和不同种植模式对土壤质量的影响，分析土壤质量退化的原因，对昆明郊区蔬菜、花卉主产县典型大棚土壤进行取样，分析测定了土壤微生物区系和酶活性的变化。结果表明，随设施种植年限的增加，土壤细菌、放线菌、微生物总数、B/F比值及土壤过氧化氢酶、脲酶和蔗糖酶活性先增加后降低，以种植6~8 a时最高而20 a时最低；真菌数量持续增加而微生物多样性指数和均匀度指数持续降低。与连作相比，轮作有利于增加土壤细菌、放线菌数量而降低真菌数量，有利于提高过氧化氢酶、脲酶和蔗糖酶活性，其中花-花轮作效果最好，菜-菜轮作效果最差。研究结果表明大棚种植初期（4~6 a）土壤生态环境较好，6~8 a后土壤微生物区系失调，酶活性显著下降，从而影响土壤生物化学过程，土壤质量的稳定性和可持续利用性大大降低；轮作种植能有效调节土壤微生物区系，有利于微生物群落多样性和稳定性的提高，有利于土壤质量的改善。