以腐熟牛粪、新鲜牛粪以及蚯蚓粪为材料，提取其微生物总DNA，利用细菌16S rDNA V3区扩增及变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）法，分析了3种材料中细菌的多样性以及细菌群落结构的相似性。结果表明，蚯蚓粪的细菌多样性最丰富，腐熟牛粪次之，新鲜牛粪的细菌多样性最小。蚯蚓粪和腐熟牛粪的细菌群落结构有40%的相似性；蚯蚓粪和新鲜牛粪的细菌群落结构的相似性为25%；新鲜牛粪和腐熟牛粪的细菌群落结构的相似性则为35%。