在现场调查和收集农业环境数据的基础上，通过地理信息系统及计算机等辅助手段，将已建立的农业非点源污染发生潜力评价系统（APPI）应用于县域范围，研究了昆山市11个城镇非点源污染负荷情况并识别出优先控制区。结果表明，昆山市非点源污染氮磷总排放量约为4.54×106 kg·a-1，其中农田氮磷排放总量约为4.30×105 kg·a-1，农村居民氮磷排放总量约为1.44×106 kg·a-1，城镇居民氮磷排放总量约为1.36×106 kg·a-1，畜禽氮磷排放总量约为1.31×106 kg·a-1。昆山市农业非点源污染发生潜力最大的3个乡镇为千灯镇、张浦镇和淀山湖镇，并对各乡镇不同类型污染源的负荷做了分析。该评价系统在太湖地区县域范围有一定的推广价值，具体参数仍需进一步完善。