为了准确评价农田生态系统在全球碳平衡中的作用，利用涡度相关技术对安徽省寿县冬小麦/水稻生态系统进行了碳通量的监测，并在数据校正、剔除和插补的基础上，研究生长季农田净生态系统碳交换（NEE）的变化特征。结果显示，2008年寿县农田生态系统CO2通量的日变化进程为单峰型，冬小麦和水稻最大的CO2吸收速率分别为2.45和2.48 mg·m-2·s-1。从物候期的角度来看，冬小麦在抽穗期碳通量值最小，乳熟期最大；水稻拔节时期碳通量值最小，即固碳能力最强。冬小麦/水稻生态系统不同月份碳通量月均日变化也呈U型曲线，作物生命活动越旺盛，NEE峰值越高，夜间CO2排放则在8月份达到最高值。2008年冬小麦和水稻月平均最大日CO2吸收峰分别出现在4月和8月，分别为1.30和1.07 mg·m-2·s-1。冬小麦生态系统NEE的日最大累积吸收量出现在4月16日，可达11.76 gC·m-2·d-1，水稻生态系统的出现在8月3日，为10.40 gC·m-2·d-1。冬小麦从拔节到成熟时间段内的固碳能力为326.87 gC·m-2，水稻从返青到成熟时间段内的固碳能力也达到了300.05 gC·m-2。