在分析小清河流域1991—2007年间畜禽养殖总量和结构变化态势的基础上，估算该流域畜禽养殖粪便总量和氮素污染负荷量及其空间分布特征。结果表明：该流域畜禽养殖粪便量（以氮含量为标准的猪粪当量计）呈现增加-下降-增加-下降的趋势，基本上是随着畜禽养殖总体数量的变化而变化。小清河流域上游地区畜禽养殖产生的粪便量最大，约占整个流域地区的58%，对小清河流域氮素污染起到主要作用。该流域畜禽粪便平均氮素污染负荷为116 kgN·hm-2，但流域各县粪便氮素污染负荷量则差异较大。负荷量大的县（区）主要集中在小清河流域的上游地区（槐荫区除外），其氮素污染负荷均高于250 kgN·hm-2欧盟的最高限制标准，尤其是历下区和天桥区的氮素污染负荷最为突出，对小清河流域水体环境影响极大。