农药、重金属已成为当今农业生态系统中重要的污染物质，国内外科学家对其进行了大量卓有建树的研究，特别是在土壤-植物系统中的研究受到较多关注。通过就农药和重金属对土壤微生物、土壤动物、土壤酶活性和植物的生理生化指标的影响进行的综合分析和阐述，系统剖析了其产生毒害机理和影响的因素，在此基础上提出今后相关研究中有待加强的重点，包括农药对非靶标生物毒害机理、农药降解中间产物的环境风险以及农药和重金属的迁移转化机理等。