以养殖废水沼气池沼泥为接种物，构建了乙二胺、三氯化铁改性阳极的无介体单室微生物燃料电池（MFC）体系，均成功实现了连续产电，同时对废水中的污染物也具有很好的去除效果。为了更好地研究微生物燃料电池阳极生物膜的微生物多样性，分别采集了两种MFC阳极生物膜样品，采用PCR-DGGE法研究了一个完整产电周期的启动期（S）、葡萄糖产电稳定期（RG）和养殖废水原水稳定期（RS）的MFC阳极生物膜的微生物群落变化。结果表明，不同时期MFC阳极生物膜的微生物多样性存在明显差异，S-RG、S-RS、RG-RS的微生物群落相似性分别为70.1%、42.0%和50.6%。两种不同阳极富集的生物膜微生物群落相似性仅为48%，这表明不同改性方法所得的阳极对微生物具有选择性作用。对DGGE条带测序和比对发现，不同时期阳极生物膜上优势微生物包括Trichococcus sp.、Thauera sp.、Azoarcus sp.、Azospirillum sp.、Zobellella sp.、Pseudomonas sp.、Aeromonas sp.、Thiobacillus sp.、Desulfovibrio sp.、Thiomonas sp.，其中Pseudomonas sp.、Aeromonas sp.和Desulfovibrio sp.与已报道的相关产电微生物具有较高的序列相似度，这些菌种可能是本MFC体系中的主要产电菌。