为了解巢湖水体沉积物中重金属的污染现状及其潜在生态危害程度，追溯水域污染历史，研究随年代变化的污染梯度及规律，对巢湖湖区及部分出入湖支流沉积物中重金属元素（Cd、Cr、Pb、Cu、Zn、Mn、Fe）的空间分布进行了调查研究，并利用潜在生态风险指数法对其进行了综合评价分析。结果表明，测定的巢湖水体沉积物重金属中Zn、Cd的含量普遍比背景值要高，部分支流中的重金属含量比湖区要高，并以西半湖的南淝河污染较为严重，并已出现复合污染的趋势。沉积物中重金属的垂直分布一般规律是在0~8 cm段出现峰值，且随采样深度的增加重金属含量有递减的趋势。利用潜在生态风险指数法对沉积物中重金属污染的评价结果显示，对巢湖生态风险构成危害程度最大的重金属是Cd，少数样点已属强生态危害。多种重金属潜在生态危害指数表明，南淝河已达到严重生态危害程度。